ふるさと納税の限度額を超えたらどうなる？超過分の損失と確認方法【2026年】

「年収600万円だから7万円くらいは大丈夫だろう」——限度額を感覚で決めて寄付し、翌年になって「思ったより住民税が減っていない」と気づく。奈良市周辺の会社員の方から、こうしたご相談を毎年いただきます。

結論からお伝えすると、限度額を超えた分は税金から控除されず、そのまま自己負担になります。やっかいなのは、超えたかどうかが寄付した時点では分からず、翌年6月に届く住民税決定通知書を見て初めて確認できるという点です。

私たち横山千夏税理士事務所では、奈良県内の会社員や個人事業主の方の確定申告・税額のご相談を、女性スタッフが中心となって承っております。この記事では、限度額を超えたときに実際いくら損をするのか、そしてご自身が超えていたかどうかを確かめる手順を、2026年現在の制度に沿ってご説明いたします。

寄付をする前の限度額の計算方法については、「ふるさと納税の限度額（上限）はいくら？年収別の計算と2026年の注意点」で年収別の目安を詳しく扱っておりますので、これから寄付をされる方はそちらをご覧ください。

限度額を超えるとどうなるのか

ふるさと納税は、寄付額のうち2,000円を超える部分が所得税と住民税から差し引かれる制度です。ただし控除できる金額には、年収・家族構成・他の控除で決まる上限があります。

上限を超えた部分は控除の対象にならず、返礼品以外のリターンがない「純粋な寄付」になります。制度の外に出てしまうイメージです。

なお、上限には二重の壁があります。ひとつは住民税の特例控除分で、住民税所得割額の2割までとされています。もうひとつは所得税側の寄付金控除で、こちらは総所得金額の40%が限度とされています。一般的な会社員の方が先にぶつかるのは前者の「所得割額の2割」の壁です。

実際いくら損をするのか｜金額で見る

「超えたら損」とは言われますが、金額で見ないと実感が湧きません。限度額5万円の方が7万円寄付したケースで整理します。

区分	寄付額	税金から戻る額	返礼品（3割相当）	実質の収支
限度額の範囲内	50,000円	48,000円	15,000円相当	約13,000円のプラス
超過分	20,000円	0円	6,000円相当	約14,000円のマイナス
合計	70,000円	48,000円	21,000円相当	約1,000円のマイナス

超過分の2万円は、6,000円相当の返礼品のために2万円を支払った計算になります。限度額の範囲内で得られたはずの利益がこれで相殺され、全体では収支がほぼゼロか、わずかにマイナスになりました。

超過額が大きくなるほどマイナスは膨らみます。3万円超えれば約2万円、5万円超えれば約3.5万円の持ち出しという計算です。

自分が超えていたか確かめる3ステップ

ここが本題です。翌年6月ごろに勤務先から配られる住民税決定通知書（正式には住民税額決定通知書・特別徴収税額の決定通知書）を使えば、控除が正しく反映されたかを自分で確認できます。

ステップ1：昨年1年間の寄付額を合計する

1月1日から12月31日までに決済が完了した寄付の合計額を出します。ポータルサイトのマイページや、自治体から届いた寄附金受領証明書で確認できます。複数のサイトを併用した方は、サイトをまたいで合計してください。

ステップ2：通知書の「寄附金税額控除」欄を見る

通知書の摘要欄または税額欄に、寄附金税額控除という項目があります。市民税分と県民税分に分かれて記載されていることが多いため、両方を足した金額が控除額です。

ステップ3：「寄付合計額 − 2,000円」と照合する

ワンストップ特例を使った方は、控除が全額住民税から行われます。そのため、

寄附金税額控除の合計 ≒ 寄付合計額 − 2,000円

となっていれば、限度額の範囲内に収まっていたと判断できます。控除額がこれより明らかに少ない場合、限度額を超えていた可能性が高いと考えられます。

確定申告をした方は、控除の一部が所得税の還付として先に戻っているため、この式では合いません。所得税の還付額（確定申告書の還付金額のうち寄付金控除に対応する部分）と住民税の控除額を足して判断する必要があります。判断が難しい場合は、源泉徴収票と通知書をお持ちいただければ当事務所でも確認いたします。

差額があるときに疑うポイント

金額が合わないときは、限度額超過のほかにも次の原因が考えられます。

• ワンストップ特例の申請書が期限（翌年1月10日必着）に間に合わなかった
• 6自治体以上に寄付していて、ワンストップ特例が無効になっていた
• 確定申告をしたことで、提出済みのワンストップ申請が無効になっていた
• 申請書の住所や氏名が住民票と一致せず、自治体で処理されなかった

超えていたと分かったら｜取り戻せる部分はあるか

過去の寄付をなかったことにはできませんが、手続きの選び方によって戻る金額が変わる場合があります。

ワンストップ特例は住民税だけで控除を完結させる仕組みのため、上限を超えた分はそのまま自己負担になりやすい構造です。一方、確定申告で寄付金控除として申告すると、住民税の特例控除の上限を超えた部分についても所得税の所得控除としての効果は残ります。所得税率に応じて、超過分の一部が所得税から軽減される計算です。

戻る金額は数千円程度にとどまることが多いものの、超過額が大きい方ほど差が出ます。手続きの選び方と具体的な流れは「ふるさと納税のワンストップ特例と確定申告｜使い分けと手続きの流れ」にまとめておりますので、あわせてご覧ください。

なお、確定申告の期限を過ぎていても、還付を受けるための申告（還付申告）は原則としてその年の翌年1月1日から5年間可能とされています。数年前の分に気づいた場合でも、間に合う可能性があります。

2026年以降に押さえておきたい制度の動き

ふるさと納税をめぐる制度は、ここ数年で続けて見直されています。2026年現在、次の変更が確認されています。

• ポータルサイトのポイント付与は2025年10月に廃止されました。返礼品以外の還元がなくなったため、寄付額を増やしても実利は返礼品分（3割以内）にとどまります
• 2026年10月から、いわゆる「6割ルール」が導入されるとされています。自治体が寄付金のうち自由に使える割合を確保する基準で、返礼品の量や必要な寄付額が見直される可能性があります
• 年収1億円を超える方への所得制限が2026年2月に閣議決定され、特例控除額に定額の上限を設ける方向とされています

いずれも「限度額を超えたときに損をする」という基本の構造は変えませんが、超過分を返礼品で取り返すことは以前より難しくなっています。限度額の管理は、以前にも増して大切になったとお考えください。

制度は今後も改正される可能性がありますので、実際の判断にあたっては総務省・国税庁の最新情報をご確認いただくか、当事務所までお問い合わせください。

来年、同じことを繰り返さないために

超過を防ぐ工夫は、それほど難しいものではありません。

1. 10月〜11月に一度シミュレーションする。年収が固まる前でも、給与明細から年間の見込みは概ね読めます
2. 年の途中で収入や控除が変わったら計算をやり直す。転職、産休・育休、退職、扶養家族の増減はいずれも限度額を動かします
3. 医療費控除や住宅ローン控除を使う年は限度額が下がる点に注意する。課税所得が減るぶん、控除できる寄付の枠も縮みます
4. 限度額の8〜9割にとどめる。目安の金額はあくまで概算であり、ぴったりまで使うと超過のリスクが残ります

住宅ローン控除とふるさと納税を同じ年に使う場合の影響は、「住宅ローン控除とふるさと納税は併用できる？限度額への影響と注意点」で扱っております。あわせて「住民税決定通知書の見方」もご参照いただくと、通知書の確認がしやすくなります。

よくある質問（FAQ）

Q. 限度額を超えた分は、あとから取り消せますか？

A. 寄付は自治体への贈与にあたるため、寄付後の取り消しや返金は原則として受け付けられないとされています。超えてしまった場合は、確定申告で戻せる部分がないかを確認する方向で検討することになります。

Q. 住民税決定通知書をなくしてしまいました。

A. 勤務先の給与担当部署に再発行を相談できる場合があります。難しい場合は、お住まいの市町村で課税証明書を取得すると、控除額を確認できることがあります。

Q. 通知書の控除額が「寄付額−2,000円」より多いのですが。

A. ふるさと納税以外の寄付金（共同募金、認定NPO法人への寄付など）が同じ欄に合算されている可能性があります。ふるさと納税分だけを切り分けて照合してください。

Q. 数年前に超えていたことに気づきました。今からできることはありますか？

A. 確定申告をしていない年について、還付申告が可能な期間内であれば手続きできる場合があります。年分と当時の状況によって扱いが変わりますので、資料をお持ちいただければ確認いたします。

Q. 夫婦それぞれが寄付する場合、限度額はどう考えますか？

A. 限度額は寄付をする方ご本人の所得と控除で決まります。夫名義のクレジットカードで妻の分を決済すると、控除が受けられなくなる場合がありますので、名義をそろえてください。

判断に迷ったら、横山千夏税理士事務所へ

ふるさと納税は仕組みが単純に見えて、複数の所得がある方、年の途中で収入が変わった方、他の控除と併用する方にとっては、限度額の見極めが一気に難しくなります。「去年いくら寄付したか分からない」「通知書を見ても合っているのか判断できない」という段階でも問題ありません。

横山千夏税理士事務所では、Zoom等を利用したオンライン相談を主体としており、奈良県内はもちろん、お忙しい会社員の方もご自宅からそのままご相談いただけます。直接お会いしてのご相談をご希望の方には、近鉄奈良駅すぐの立地で来所相談も承っております。

税金の話が初めてという方にも、女性税理士・女性スタッフが言葉をかみくだいてご説明いたします。源泉徴収票と住民税決定通知書をお手元にご用意のうえ、オンライン相談・来所相談、または当事務所の問い合わせフォームからお気軽にご連絡ください。